در مجله جهاد، مقالات ارسالی و ثبت شده در سامانه، پس از بررسی از نظر هم راستایی با حوزه تخصصی و سیاست‌های مجله، همچنین، رعایت ساختار و قالب تعیین شده در سامانه، وارد فرآیند داوری می‌گردد و پس از طی مراحل داوری و تایید نهایی سردبیر وارد روند چاپ می‌شود.
ضمناً، رویه داوری در این مجله، دوسوکور است و در آن نه نویسنده از هویت داوری مطلع می‌شود و نه داور از نام و نشان نویسنده(گان) آگاهی می‌یابد.
مجدداً تاکید می‌گردد که در مجله جهاد تنها مقالات در خصوص مسائل، دستاوردها و تجارب نوین در حوزه علوم و فنون آموزش، ترویج، توسعه روستایی و کشاورزی و زمینه‌های وابسته که با دیدی تحلیلی و انتقادی تهیه شده باشند مورد بررسی و چاپ قرار می‌گیرد.
در ادامه فلوچارت رسیدگی به مقالات ارائه شده است